好像正常的運作方式，事實上卻因廠房出租不夠、用地過度開發及租金過於便宜等問題，造成工業廠房管理作業資金負債累累，據負責人了解，工業廠房管理基金從民國99年到100年間的負債，就爆增超過100億元，是蓋一座發電量達1320萬瓦的水壩的金額，也是所有投資金額，除此之外，每年光是花在利息費用上的金額，就超過15億新台幣，不斷流掉的管理資金，就像一個無底洞，終將消耗全國的納稅錢，作業基金預算評估報告中，明確指出該作業花費的問題，認為部分工業用地與廠房出售率不好，有待改善，同時也提醒廠房租售單位，台灣經濟成長預測估計已趨緩，資金收入究竟是否能如預期般的成長，難以預料，應做好風險控管，降低基金的營運風險。
一個典型的勞動密集型產業區，有500多個大大小小的工業不動產，都是社區自我建設，沒有規劃，環境又不太好，品質也不好，全是標準的工業廠房，卻無租金利潤，預估之後可能利用模式包括現在有的廠房租售招商，或拆除重建工業廠房，另外也有可能是規劃工業用地出售，但機率比較低，或是申請土地變更為住宅區，但困難重重，而且非常挖費時間，大量的購買土地對不動產具指標意義，專家表示目前房巿購買不佳，希望市場再壞也壞不過現在，應可望在下半年逐漸改善。
從2011年同期來講，我們現在85%的企業創造的經濟總量才6%，那就是3%的企業創造了94%的價值，即便有多事廠房得以另覓土地重新出發，還是有好幾千名員工被迫重新找工作，但問題是多數在這些傳統小工廠工作的員工，都是有些年紀，且沒有太多其他專長的勞工，轉業對他們來說絕非易事，工業用地改革新政實施細則或會通過補交地價等方式，讓社區的統建樓綠本轉紅本，用來盤活社區股份公司經濟，讓工業廠房辦證，可以讓承租人辦理營業執照，利於這些廠房出租與出售。
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